8月13日下午，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心舉辦了“人體微生物組數(shù)據(jù)分析和可視化”培訓(xùn)，旨在幫助科研人員了解和掌握相關(guān)技術(shù)和工具，以提升自身生物信息分析能力。本次培訓(xùn)由中心資深工程師李強(qiáng)擔(dān)任主講人，其為中心微生物組學(xué)分析云平臺（integrated Microbiome Analysis Cloud，簡稱iMAC）負(fù)責(zé)人，主要研究方向?yàn)槲⑸锝M學(xué)云分析流程開發(fā)及搭建、大數(shù)據(jù)分析算法開發(fā)等。

李強(qiáng)首先向?qū)W員們介紹了人體微生物組的研究進(jìn)展。近年來，腸道微生物組研究領(lǐng)域迅速發(fā)展，學(xué)術(shù)文獻(xiàn)數(shù)量和研究資金投入均大幅增加，推動該領(lǐng)域進(jìn)入了黃金時代。飲食與腸道微生物組的相互作用研究取得了顯著進(jìn)展，個性化營養(yǎng)策略逐漸興起，為代謝性疾病、免疫性疾病等多種疾病的治療和管理提供了全新的思路。隨后，他介紹了微生物組學(xué)的研究實(shí)踐，包括如何獲得樣品序列信息及測序結(jié)果的解讀等。最后，他詳細(xì)介紹了微生物組學(xué)分析云平臺，該平臺是微生物組學(xué)數(shù)據(jù)一站式分析平臺，訪問地址為https://www.biosino.org/iMAC。

培訓(xùn)過程中，李強(qiáng)以16S rRNA流程為例，帶領(lǐng)學(xué)員們詳細(xì)操作了iMAC平臺。現(xiàn)場演示引導(dǎo)學(xué)員們積極參與，并進(jìn)行了深入的交流和討論。此次培訓(xùn)不僅使學(xué)員們對微生物組的應(yīng)用有了更深入的了解，還掌握了iMAC平臺的實(shí)際操作。這將進(jìn)一步提升學(xué)員們對所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心提供的常規(guī)生物信息分析服務(wù)的了解，為科學(xué)研究工作提供有力支持。

營養(yǎng)與健康所所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心將持續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動，以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務(wù)。同時，所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心還設(shè)計(jì)了相關(guān)的調(diào)研問卷（詳見文末二維碼），誠邀科研人員提出寶貴的意見和建議，以便進(jìn)一步優(yōu)化和提升服務(wù)質(zhì)量。通過與科研人員的積極互動和反饋，中心將不斷改進(jìn)服務(wù)流程，提升技術(shù)支持質(zhì)量，為進(jìn)一步滿足科研需求提供更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。

李強(qiáng)工程師作培訓(xùn)報(bào)告

關(guān)于iMAC平臺：

iMAC是一個集成的、公開免費(fèi)且友好的微生物組分析云平臺，旨在系統(tǒng)、全面地分析16S rRNA擴(kuò)增子和宏基因組的原始數(shù)據(jù)。用戶只需要上傳數(shù)據(jù)，選擇感興趣的流程，并根據(jù)需求靈活調(diào)整默認(rèn)參數(shù)，任務(wù)就會自動提交到云端進(jìn)行處理，最終結(jié)果以在線交互式圖形和詳細(xì)PDF報(bào)告等文件呈現(xiàn)。iMAC平臺支持的分析流程包括：16S rRNA 流程、mWGS-reads流程、mWGS-MAG流程和mWGS-assembly流程。此外，iMAC還提供用于進(jìn)一步分析的高級工具。 16S rRNA流程基于Qiime2，主要包括物種多樣性研究、差異菌群研究和差異功能研究。