上海藥物所合作舉辦2023上海國際計算生物學(xué)創(chuàng)新大賽

文章來源:上海藥物研究所  |  發(fā)布時間:2024-09-30  |  【打印】 【關(guān)閉

  

2024年9月9日,2023(首屆)上海國際計算生物學(xué)創(chuàng)新大賽——藥物篩選AI算法“凌越”挑戰(zhàn)賽在2024浦江創(chuàng)新論壇(上海國際計算生物學(xué)創(chuàng)新專題論壇)上宣布收官并舉行頒獎儀式。本次大賽貫徹國家、上海市和中國科學(xué)院融合人工智能(AI)推動生物醫(yī)藥發(fā)展的戰(zhàn)略部署,在上海市科學(xué)技術(shù)委員會指導(dǎo)下,由上海市生物醫(yī)藥科技發(fā)展中心聯(lián)合上海藥物所、中國銀行上海市分行和華為云等單位共同舉辦。

?“凌越”寓意“飛凌超越”,是藥物所原創(chuàng)新藥研究全國重點實驗室的項目品牌。藥物所原創(chuàng)新藥研究全國重點實驗室作為本次大賽的出題方,聚焦人工智能在離子通道藥物研發(fā)中的應(yīng)用,以NMDA(N-methyl-D-aspartate,N-甲基-D-天冬氨酸)受體為靶標進行藥物虛擬篩選。NMDA受體是在中樞神經(jīng)中廣泛分布的一類興奮性受體,調(diào)控神經(jīng)發(fā)育、學(xué)習(xí)和記憶等生理功能,是一類重要的蛋白靶標。NMDA受體與多種疾病相關(guān),如腦卒中、抑郁癥、癲癇、AD等,是神經(jīng)系統(tǒng)性疾病最熱門的藥物開發(fā)靶點之一,靶向NMDA受體的藥物開發(fā)具有重要的臨床意義和市場價值。NMDA受體家族包含多個亞基,功能性的NMDA受體是由不同亞基形成的異源四聚體,因此亞基多樣性決定了NMDA受體的亞型多樣性。本次大賽重點關(guān)注的GluN1/GluN3A是NMDA受體亞型之一,目前還未作為靶點廣泛開發(fā)。特異性小分子調(diào)節(jié)劑以及晶體結(jié)構(gòu)信息的匱乏,極大地限制了該靶點的進一步研究。本次大賽基于NMDA受體家族已知的蛋白序列、結(jié)構(gòu)及活性分子信息,通過AI算法發(fā)現(xiàn)潛在的特異性作用于GluN1/GluN3A亞型的高活性分子,進而在評選過程中引入濕實驗驗證。藥物所離子通道平臺承擔本次大賽“濕實驗”驗證工作,采用離子通道研究領(lǐng)域廣泛認可的藥物發(fā)現(xiàn)與評價方案,通過實驗驗證AI技術(shù)篩選出的潛在高活性分子的特異性和有效性。這一創(chuàng)新性方式深度融合了AI技術(shù)和傳統(tǒng)藥物研發(fā)的過程,實現(xiàn)在真實場景中驗證和優(yōu)化算法的同時增加算法和潛力分子的落地價值,有效提升評選的科學(xué)嚴謹性和實用價值。

自2023年12月15日賽事公布之日起,大賽吸引了逾1300名專業(yè)人才參加,組建了超過330支競賽團隊。經(jīng)過多輪評審,一批尖端算法和具有潛力的高活性分子在大賽中脫穎而出。決賽現(xiàn)場,5支團隊進行“巔峰對決”。最終,本次大賽結(jié)合濕實驗得分(占70%)、決賽現(xiàn)場匯報答辯、建模探索過程、建模方案創(chuàng)新性等維度的綜合打分,評選出一等獎1名、二等獎2名、三等獎2名。藥物所陳凱先院士、李佳所長、原創(chuàng)新藥研究全國重點實驗室高召兵主任等嘉賓分別為獲獎團隊頒獎。?

原創(chuàng)新藥研究全國重點實驗室高召兵主任受邀做報告

陳凱先院士等為一等獎獲獎團隊頒獎

藥物所所長李佳、原創(chuàng)新藥研究全國重點實驗室主任高召兵等為二等獎獲獎團隊頒獎