上海藥物所合作舉辦2023上海國(guó)際計(jì)算生物學(xué)創(chuàng)新大賽
文章來源:上海藥物研究所 | 發(fā)布時(shí)間:2024-09-30 | 【打印】 【關(guān)閉】
2024年9月9日,2023(首屆)上海國(guó)際計(jì)算生物學(xué)創(chuàng)新大賽——藥物篩選AI算法“凌越”挑戰(zhàn)賽在2024浦江創(chuàng)新論壇(上海國(guó)際計(jì)算生物學(xué)創(chuàng)新專題論壇)上宣布收官并舉行頒獎(jiǎng)儀式。本次大賽貫徹國(guó)家、上海市和中國(guó)科學(xué)院融合人工智能(AI)推動(dòng)生物醫(yī)藥發(fā)展的戰(zhàn)略部署,在上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)指導(dǎo)下,由上海市生物醫(yī)藥科技發(fā)展中心聯(lián)合上海藥物所、中國(guó)銀行上海市分行和華為云等單位共同舉辦。
?“凌越”寓意“飛凌超越”,是藥物所原創(chuàng)新藥研究全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的項(xiàng)目品牌。藥物所原創(chuàng)新藥研究全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室作為本次大賽的出題方,聚焦人工智能在離子通道藥物研發(fā)中的應(yīng)用,以NMDA(N-methyl-D-aspartate,N-甲基-D-天冬氨酸)受體為靶標(biāo)進(jìn)行藥物虛擬篩選。NMDA受體是在中樞神經(jīng)中廣泛分布的一類興奮性受體,調(diào)控神經(jīng)發(fā)育、學(xué)習(xí)和記憶等生理功能,是一類重要的蛋白靶標(biāo)。NMDA受體與多種疾病相關(guān),如腦卒中、抑郁癥、癲癇、AD等,是神經(jīng)系統(tǒng)性疾病最熱門的藥物開發(fā)靶點(diǎn)之一,靶向NMDA受體的藥物開發(fā)具有重要的臨床意義和市場(chǎng)價(jià)值。NMDA受體家族包含多個(gè)亞基,功能性的NMDA受體是由不同亞基形成的異源四聚體,因此亞基多樣性決定了NMDA受體的亞型多樣性。本次大賽重點(diǎn)關(guān)注的GluN1/GluN3A是NMDA受體亞型之一,目前還未作為靶點(diǎn)廣泛開發(fā)。特異性小分子調(diào)節(jié)劑以及晶體結(jié)構(gòu)信息的匱乏,極大地限制了該靶點(diǎn)的進(jìn)一步研究。本次大賽基于NMDA受體家族已知的蛋白序列、結(jié)構(gòu)及活性分子信息,通過AI算法發(fā)現(xiàn)潛在的特異性作用于GluN1/GluN3A亞型的高活性分子,進(jìn)而在評(píng)選過程中引入濕實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。藥物所離子通道平臺(tái)承擔(dān)本次大賽“濕實(shí)驗(yàn)”驗(yàn)證工作,采用離子通道研究領(lǐng)域廣泛認(rèn)可的藥物發(fā)現(xiàn)與評(píng)價(jià)方案,通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證AI技術(shù)篩選出的潛在高活性分子的特異性和有效性。這一創(chuàng)新性方式深度融合了AI技術(shù)和傳統(tǒng)藥物研發(fā)的過程,實(shí)現(xiàn)在真實(shí)場(chǎng)景中驗(yàn)證和優(yōu)化算法的同時(shí)增加算法和潛力分子的落地價(jià)值,有效提升評(píng)選的科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)性和實(shí)用價(jià)值。
自2023年12月15日賽事公布之日起,大賽吸引了逾1300名專業(yè)人才參加,組建了超過330支競(jìng)賽團(tuán)隊(duì)。經(jīng)過多輪評(píng)審,一批尖端算法和具有潛力的高活性分子在大賽中脫穎而出。決賽現(xiàn)場(chǎng),5支團(tuán)隊(duì)進(jìn)行“巔峰對(duì)決”。最終,本次大賽結(jié)合濕實(shí)驗(yàn)得分(占70%)、決賽現(xiàn)場(chǎng)匯報(bào)答辯、建模探索過程、建模方案創(chuàng)新性等維度的綜合打分,評(píng)選出一等獎(jiǎng)1名、二等獎(jiǎng)2名、三等獎(jiǎng)2名。藥物所陳凱先院士、李佳所長(zhǎng)、原創(chuàng)新藥研究全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室高召兵主任等嘉賓分別為獲獎(jiǎng)團(tuán)隊(duì)頒獎(jiǎng)。?
原創(chuàng)新藥研究全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室高召兵主任受邀做報(bào)告
陳凱先院士等為一等獎(jiǎng)獲獎(jiǎng)團(tuán)隊(duì)頒獎(jiǎng)
藥物所所長(zhǎng)李佳、原創(chuàng)新藥研究全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任高召兵等為二等獎(jiǎng)獲獎(jiǎng)團(tuán)隊(duì)頒獎(jiǎng)