【新民晚報】上海科學(xué)家在水稻基因打靶技術(shù)上取得突破 極大方便植物育種和研究
文章來源:分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心 | 發(fā)布時間:2020-07-09 | 【打印】 【關(guān)閉】
新民晚報訊(記者 郜陽)中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心朱健康研究員領(lǐng)銜的團隊在植物基因組編輯領(lǐng)域再次取得重要進展。他們采用修飾后的DNA片段作為供體,在水稻上建立了一種高效的片段靶向敲入和替換技術(shù),高至50%的靶向敲入效率將極大方便植物的研究和育種。相關(guān)研究成果已于近日在線發(fā)表在國際頂級生物技術(shù)期刊《自然·生物科技》上。
近年來,CRISPR/Cas介導(dǎo)的植物基因組定點編輯技術(shù)在農(nóng)作物基因功能研究和精準育種中發(fā)揮了重要作用,展現(xiàn)了廣闊的發(fā)展?jié)摿蛻?yīng)用前景。不過,CRISPR/Cas介導(dǎo)的植物基因組定點敲除技術(shù)只能在基因組特定位點產(chǎn)生隨機插入和刪除,精準的片段插入和替換的效率一直很低,極大地限制了其在植物研究和育種上的應(yīng)用。因此,迫切需要建立更高效的植物基因組片段插入和替換技術(shù)體系。
植物基因組編輯是朱健康研究組的重點研究領(lǐng)域,他們在近幾年來取得了一系列進展。作為該領(lǐng)域的重大難題,片段的靶向敲入和替換一直是研究人員的重要研究目標,他們也一直在圍繞這一目標努力。在成功地建立了病毒介導(dǎo)的同源重組(HDR)和各類單堿基編輯技術(shù)等多種方法的同時,他們也開始嘗試在供體DNA片段上尋找突破點,以克服現(xiàn)有方法效率低、應(yīng)用范圍窄等缺陷。
核酸修飾在人的RNAi療法和核酸疫苗等醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有廣泛的應(yīng)用。朱健康研究組通過嘗試,發(fā)現(xiàn)將供體片段同時進行硫代修飾和磷酸化修飾后,能極大地增強CRISPR/Cas9引導(dǎo)的靶向敲入效率。研究團隊先后在14個基因位點上成功靶向敲入了各類調(diào)控元件,包括翻譯增強子、轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,甚至整個啟動子,供體片段最長達2049bp。通過對1393株各類T0代基因編輯水稻植株的分析發(fā)現(xiàn),該方法的敲入效率可高達47.3%,平均效率為25%。高效的敲入效率甚至可以同時在四個位點上實現(xiàn)多基因靶向敲入。可以預(yù)計,該技術(shù)的建立將使靶向敲入成為一項和靶向敲除一樣的常規(guī)實驗,被各個植物研究和育種單位廣泛應(yīng)用。
在此基礎(chǔ)上,朱健康研究團隊又巧妙地設(shè)計了一種片段精準替換的策略,稱為重復(fù)片段介導(dǎo)的同源重組(TR-HDR)方法。常規(guī)的HDR頻率極其低下,但他們在前期的實驗中發(fā)現(xiàn),基因組上串聯(lián)重復(fù)片段間的HDR頻率非常高。他們利用這一現(xiàn)象,通過將修飾的片段靶向敲入至目標位點后,人為制造這種串聯(lián)重復(fù)結(jié)構(gòu),誘導(dǎo)TR-HDR去實現(xiàn)片段替換。采用該技術(shù),他們在五個基因位點上實現(xiàn)了片段替換和原位的Flag標簽蛋白的精準融合,效率最高達到了11.4%。這一技術(shù)突破將非常有助于植物學(xué)研究,并大大促進農(nóng)作物定向遺傳改良的進程。
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